Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Exploiting Syntax when Detecting Protein Names in Text
RISE., Swedish ICT, SICS.ORCID-id: 0000-0001-6949-6380
RISE., Swedish ICT, SICS.
RISE., Swedish ICT, SICS.
Visa övriga samt affilieringar
2002 (Engelska)Ingår i: Proceedings of FMI Workshop on Natural Language Processing in Biomedical Applications, 2002, 1, , s. 6Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
Abstract [en]

This paper presents work on a method to detect names of proteins in running text. Our system - Yapex - uses a combination of lexical and syntactic knowledge, heuristic filters and a local dynamic dictionary. The syntactic information given by a general-purpose off-the-shelf parser supports the correct identification of the boundaries of protein names, and the local dynamic dictionary finds protein names in positions incompletely analysed by the parser. We present the different steps involved in our approach to protein tagging, and show how combinations of them influence recall and precision. We evaluate the system on a corpus of MEDLINE abstracts and compare it with the KeX system (Fukuda et al., 1998) along four different notions of correctness.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2002, 1. , s. 6
Nationell ämneskategori
Data- och informationsvetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:ri:diva-22240OAI: oai:DiVA.org:ri-22240DiVA, id: diva2:1041785
Konferens
EFMI Workshop on Natural Language Processing in Biomedical Applications, March 8-9, 2002, Nicosia, Cyprus
Tillgänglig från: 2016-10-31 Skapad: 2016-10-31 Senast uppdaterad: 2020-12-02Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(203 kB)78 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 203 kBChecksumma SHA-512
7f186ce905aeb99bf3569ae40f639e4f1d33bababe38d09ee66021ad91514ad3abb64dfe902096c13c2d9af166a126fa9160d6a342cfc61c4135850116d09d58
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

http

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Eriksson, Gunnar
Av organisationen
SICS
Data- och informationsvetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 78 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 37 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf